Évolution et Écologie

Nos recherches visent à comprendre l’impact des changements globaux (anthropiques et climatiques) sur la diversité, l’abondance et l’écologie des insectes dans le contexte de la sécurité alimentaire et de la santé publique. Nous travaillons sur des modèles d’insectes ayant des impacts positifs sur le bien-être humain, tels que les insectes pollinisateurs, les insectes comestibles et les ennemis naturels des insectes nuisibles, et également des impacts négatifs tels que les ravageurs des cultures et les vecteurs de parasites des mammifères. Les objectifs sont d’identifier les mécanismes qui sous-tendent les réponses de ces insectes aux pressions biotiques et abiotiques, et de prédire les impacts et retroactions sur les changements globaux dans une perspective de gestion et de conservation. Les principaux sites d’étude sont situés en Europe continentale, en Afrique sub-Saharienne et en Amérique latine.

Nos implantations et partenariats :

implantations

Quatre grands axes de recherche sont développés au sein de notre pôle :

Ecologie d’insectes à enjeux de production ou de conservation : les changements d’usage des terres et les bouleversements climatiques peuvent affecter l’abondance, la richesse et la diversité des populations d’insectes à enjeux de production ou de conservation. Dans ce contexte, nous étudions l’écologie d’insectes comestibles, l’écologie des abeilles à travers des approches expérimentales et empiriques ainsi que l’impact de ravageurs exotiques sur des populations d’insectes natifs incluant les parasitoïdes et sur des populations de proies natives (interaction frelon asiatique – abeilles mellifères).
Adaptation des insectes aux environnements anthropisés : certaines actions anthropiques conduisent à la réduction des habitats naturels et à l’invasion d’espèces pouvant affecter l’agriculture et la santé humaine. Nous étudions en particulier l’adaptation à l’hôte chez les parasitoïdes utilisés en lutte biologique, l’évolution de l’adaptation du régime alimentaire des prédateurs comme des Coccinellidae et les processus de domiciliation d’insectes vecteurs de maladies.
Modéliser la réponse des insectes aux changements globaux : dans un contexte de changements globaux, il est difficile de disposer de modèles de prédiction de la réponse individuelle et populationnelle des insectes. Pour y remédier, nous modélisons la phénologie des insectes (ex. : ravageurs de cultures) et la dispersion spatio-temporelle des populations d’insectes à partir de données expérimentales ou participatives sur les climats, paysages et pratiques culturales. Nous utilisons également la modélisation en combinaison avec des données de terrain comme un outil d’aide à la décision pour la gestion environnementale et pour l’analyse de scénarios complexes à expérimenter sur le terrain comme la combinaison de stress multiples.
Rôle fonctionnel des insectes dans les agroécosystèmes : par leurs fonctions écologiques, les insectes déterminent l’équilibre dynamique des écosystèmes. Ces services et dis-services sont clés pour la sécurité alimentaire et la santé humaine. Nous étudions leur résilience en analysant conjointement les services de pollinisation rendu pas les insectes et les dis-services liés aux ravageurs dans les systèmes agricoles et anthropisés.

Méthodologies :

Etudes de terrain
- Recensement de l’usage des sols et de la structure du paysage
- Suivi à long terme des populations
- Suivi des mouvements d’insectes in natura
- Expérimentations en plein champ et en conditions controlées
- Collectes de données participatives par coopération digitale
Génétique des populations
- Analyse de gènes mitochondriaux et nucléaires
- Analyse de locus microsatellites
- RADseq (Restriction site Associated DNA sequencing)
- Démogénétique environnementale
Génomique et transcriptomique
- Séquençage ADN et ARN Haut Débit
- Analyses LC-MS-MS (protéomique)
Comportement et Electrophysiologie
- Suivis du comportement des insectes par olfactométrie et par enregistrements vidéos
- Suivis automatique (RFID) de l’ontogénèse des insectes
- Olfaction et gustation extracellulaires
Modélisation et Bioinformatique
- Modèles statistiques d’inférence démogénétique
- Modèles méchanistiques
- Modèles individus-centrés et modèles bayésiens
- Analyse des génomes et transcriptomes, recherche de QTLs,…

Les membres de l’équipe :

Héloïse Bastide, maître de conférences, Paris-Sud 11. Génomique évolutive des insectes.	Paul-André Calatayud, chargé de recherche, IRD. Interactions plantes -insectes ravageurs – parasitoïdes. Impliqué dans les axes de recherche 1, 2 et 3.
Claire Capdevielle-Dulac, ingénieure d’étude, IRD. Développement et analyse de marqueurs moléculaires.	Yves Carton, directeur de recherche émérite, CNRS. Histoire des Sciences biologiques, concernant l’entomologie, le darwinisme et l’immunité innée.
Lionel Garnery, maître de conférences, Université Versailles Saint-Quentin en Yvelines.	Myriam Harry, Professeur, Paris-Saclay. Phylogénomique et génomique des insectes vecteurs, processus de domiciliation.
Rémi Jeannette, technicien de recherche, IRD.	Laure Kaiser-Arnauld, directrice de recherche, CNRS. Interactions entre insectes ravageurs et insectes parasitoïdes et leur utilisation en lutte biologique.
Philippe LeGall, chargé de recherche, IRD. Ecologie des insectes comestibles.	Hélène, Legout, assistante ingénieure, CNRS. Mise au point et mise en œuvre de techniques en biologie moléculaire et éco-éthologie, principalement impliquée dans l’axe de recherche 1.
Taiadjana Marques Fortuna, ingénieure de recherche, IRD. Interactions entre plantes-insectes (ravageurs et parasitoïdes) dans le contexte de lutte biologique. Impliquée dans l’axe de recherche 2.	Nuambote, Ovide Yobila, doctorant, ABIES AgroParisTech, France. Mécanismes de résistance du maïs à un ravageur exotique. Impliqué dans l’axe de recherche 1.
Marie Merle, doctorante, Université Paris-Saclay, France. Implication des récepteurs chimiosensoriels dans le processus de domiciliation d’un vecteur de la maladie de Chagas. Impliquée dans l’axe de recherche 2.	Isabelle Merle, postDoc, IRD. Service de pollinisation rendu par les insectes en production de Cacao.
Alice Michel-Salzat, maître de conférences, Université Paris Diderot. Evolution de l’adaptation du régime alimentaire des prédateurs comme des Coccinellidae.	Étienne Minaud, doctorant, ABIES, France. Ecologie de l’abeille mellifère.
Florence Mougel, maître de conférences, Paris-Saclay. Approches génétiques et génomiques de l’adaptation des insectes.	François Rebaudo, ingénieur de recherche, IRD. Réponse des insectes aux changements globaux.
Baptiste Régnier, doctorant, ABIES, France. Modélisation de la phénologie d’insectes ravageurs des cultures dans des agro-écosystèmes tropicaux.	Fabrice Requier, chargé de recherche, IRD. Ecologie des abeilles et service de pollinisation.
Stéphane Aumasson, technicien de recherche, CNRS.	Malena Sibaja Leyton, doctorante, ED ABIES, AgroParisTech, France. Réponse des abeilles sociales aux pressions anthropiques.
Clémence Riva, postDoc, IRD. Service de pollinisation rendu par les abeilles.	Sacha Revillon, doctorant, ED SDSV, Université Paris-Saclay, France. Rôle de la phénologie des plantes et de leurs ravageurs sur leurs interactions.
Samuel Gornard, doctorant, ED Sciences de la nature et de l’Homme : évolution et écologie, MNHN, France. Composantes génétiques et physiologiques impliquées dans la différence de virulence de deux souches du parasitoïde Cotesia typhae.	Alexia Mouchet, postDoc, IRD. Déterminants de la dynamique spatio-temporelle des ravageurs du maïs.
Élise Verrier, postDoc, IRD. Modélisation de la résilience des colonies d’abeilles.

Stéphane Dupas, chargé de recherche, IRD.

Démogénétique environnementale des insectes et maladies de plantes et valorise les services écosystémiques rendus par l’agroécologie, par des systèmes participatifs.

Camilo Patarroyo, doctorant, UniAndes, Colombie.

Démogénétique environnementale des insectes et maladies de plantes et valorise les services écosystémiques rendus par l’agroécologie, par des systèmes participatifs.