After a master’s degree in Evolutionary and Behavioral Ecology in Tours (37), I am doing a PhD in molecular ecology, under the supervision of Ms Kaiser-Arnauld and Mougel-Imbert. My PhD focuses on the virulence differences between two strains of the parasitoid wasp Cotesia typhae (Kobodo and Makindu), when they parasitize the larva of the lepidopteran Sesamia nonagrioides (also know as Mediterranean corn borer). To do so, we are studying virulence from a molecular point of view, particularly through the differential expression of genes (by mRNA sequencing of both the wasp and the host) and the protein composition of the venom. Thus, we expect to identify, in the venom, proteins that might key virulence factor in the parasitism success.
My research involves field trials, to understand Apis and non-Apis contribution to the pollination of major crops (e.g apple) and their capacity to ensure pollination services and crop productivity. My work is currently supported by the PRIMA project SafeAgroBee. If you want to learn more about the this project please follow the link: https://www.safeagrobee.com/
Vincent Loiseau PhD student, Doctoral School “Structure et Dynamique des Systèmes Vivants”, University Paris-Saclay Study of mechanisms and frequency of virus-mediated horizontal transfers of genetic material between animals. Supervisor : Clément Gilbert. PhD obtained on 2020, september 21
Andreas Odorico Doctoral School “Structure et Dynamique des Systèmes Vivants”, University Paris-Saclay Evolution of gene regulatory networks: theoretical models vs. empirical data. Supervisor : Arnaud Le Rouzic PhD obtained on 2019, december 12
Cécile Courret Doctoral School “Structure et Dynamique des Systèmes Vivants”, University Paris-Saclay Molecular bases of the genetic conflict caused by sex chromosome segregation distortion in Drosophila simulans. Supervisor : Catherine Montchamp-Moreau. PhD obtained on 2019, december 2 Currently: Post-doctoral position in USA
Maryem Bouallegue Doctoral School “Structure et Dynamique des Systèmes Vivants” University Paris-Saclay/University of Tunis. Supervisor : Pierre Capy Currently: Assistant Professor in Tunisia
Estelle Rünneburger Doctoral School “Structure et Dynamique des Systèmes Vivants” (Paris-sud 11 University) Evolution des réseaux de gènes. Causes et conséquences de l’évolution du phénotype. Supervisor : Arnaud Le Rouzic PhD obtained on 2016
Bastien Saint-Léandre Doctoral School “Structure et Dynamique des Systèmes Vivants” (Paris-sud 11 University) Regulation of transposable elements via the piRNA pathway: Differences between male and female germlines and consequennces on transposition dynamics. Supervisor : Pierre Capy and Aurélie Hua-Van. PhD obtained in 2016 Currently: Post-doctoral position
Quentin Helleu Doctoral School “Structure et Dynamique des Systèmes Vivants” (Paris-sud 11 University) Cartographie génétique d’éléments distorteurs chez Drosophila simulans. Supervisor : Catherine Montchamp-Moreau. PhD obtained in 2015 Currently: Post-doctoral position
Thibault Scalvenzi Doctoral School Genes, Genomes, Cells (Paris-sud 11 University). Supervisor: Nicolas Pollet
Héloïse Bastide Doctoral School Genes, Genomes, Cells (Paris-sud 11 University).Evolutionary history of sex-ratio segregation distortion in Drosophila simulans”. Population molecular polyporphism, phylogeography. Supervisor : Catherine Montchamp-Moreau. Currently : Assistant Professor at University Paris-Saclay
Delphine Legrand PhD student, Doctoral School Genes, Genomes, Cells (Paris-sud 11 University). .Phylogeography and evolution of drosophila species of the melanogaster subgroup in the Indian Ocean archipelagos. Molecular Polymorphism, phylogeography, molecular basis of adaptation Currently: CNRS researcher
Lucie Fouvry Doctoral School Genes, Genomes, Cells (Paris-sud 11 University).Molecular basis and evolution of sex-ratio segregation distortion. Supervisor : Catherine Montchamp-Moreau. Currently High school teacher.
Gabriel Da Luz Wallau Universidade Federal de Santa Maria – BRAZIL Evolution and horizontal transfer of mariner element in drosophila sequenced genomes. Supervisor : Pierre Capy/Elgion Loreto (Brazil) Currently: Researcher in Brazil
Thibaud Boutin Doctoral School Genes, Genomes, Cells (Paris-sud 11 University). Long term invasion dynamics of transposable elements, a theoretical approach. PhD obtained in 2010, september 16 Supervisor: Pierre Capy
Sophie Picot Doctoral School Genes, Genomes, Cells (Paris-sud 11 University). Activity of the transposable element mariner in natural populations of Drosophila simulans Supervisor: Pierre Capy & Aurélie Hua-Van PhD obtained in 2008
Lieu du stage : UMR EGCE (www.egce.cnrs-gif.fr), campus CNRS de Gif-sur-Yvette (91), 10 minutes à pied du RER B
Encadrement : Fabrice Requier
Période – Durée : 6 mois (2021)
Contexte
En Europe, l’abeille mellifère Apis mellifera présente une double nature comme espèce gérée et espèce sauvage (Requier et al. 2019). Même si les populations sauvages d’A. mellifera constituent une composante menacée de la faune indigène, trop peu d’attention ont été portées sur le suivi de ces populations (Requier & Crewe 2019, Seeley 2019). Néanmoins, des études récentes ont montré que des colonies sauvages d’A. mellifera peuvent être trouvées dans les forêts du nord de la Pologne (Oleksa et al. 2013) et d’Allemagne centrale (Kohl & Rutschmann 2018). Les cavités creusées par des pics ou résultant de la décomposition du bois constituent les principaux sites de nidification de ces colonies sauvages dans les forêts (Requier et al. 2020). D’autres sites de nidifications existent, comme des cavités de roche ou des structures humaines (ex. : cheminées, Canteneur 1982). Cependant, la complexité d’exportation de larges territoires limite à ce jour les connaissances sur l’écologie des colonies sauvages d’abeilles mellifères et empêche l’établissement d’un statu de conservation (IUCN).
Objectifs
Ce stage vise à étudier l’organisation spatiale des colonies sauvages d’abeilles mellifères dans un territoire, avec un double objectif, fondamental : connaissance sur l’écologie des abeilles, et appliqué : aide à l’exploration du territoire. Pour ce faire, ce stage se fera en deux étapes : (1) sur la base de l’analyse de données existantes de géolocalisation des colonies sauvages d’abeilles mellifères, le/la stagiaire étudiera la distribution spatiale des colonies et testera des hypothèses d’organisations spatiales (compétition, prédation, territorialisme, hybridation, etc.). Les résultats de cette première étape permettront d’affiner un design expérimental d’exploration réduite/orientée du territoire (basé sur la prédiction spatiale de présence de colonies), et d’explorer de nouveaux sites d’études. (2) Le/la stagiaire procédera à l’exploration réduite/orientée de nouveaux sites d’études dans le parc naturel régional de la Haute Vallée de Chevreuse (en forêt de Rambouillet, à 30mins du laboratoire EGCE). L’exploration spatiale consistera en l’observation systématique de cavités (arbres, roches, etc.), description standardisée et géolocalisation, présence/absence de colonie d’abeilles, et échantillonnage d’individus. Les résultats des explorations seront comparés avec les prédictions (issues des données existantes) afin de procéder à des testes de validation croisée.
Références bibliographiques
Canteneur, R. (1982). Bee (Apis mellifera) colonies living in the wild. An epidemiological survey. Abeille de France.
Kohl, P. L., & Rutschmann, B. (2018). The neglected bee trees: European beech forests as a home for feral honey bee colonies. PeerJ, 6, e4602. https://doi.org/10.7717/peerj.4602
Requier, F., Paillet, Y., Laroche, F., Rutschmann, B., Zhang, J., Lombardi, F., Svoboda, F., Steffan-Dewenter, I. (2020) Contribution of European forests to safeguard wild honey bee populations. Conservation Letters, 13, e12693.https://doi.org/10.1111/conl.12693
Requier, F., Garnery, L., Kohl, P.L., Njovu, H.K., Pirk, C.W.W., Crewe, R.M., Steffan-Dewenter, I. (2019) The conservation of native honey bees is crucial. Trends in Ecology & Evolution 34(9), 789-798.https://doi.org/10.1016/j.tree.2019.04.008
Seeley, T. D. (2019). The Lives of Bees: The Untold Story of the Honey Bee in the Wild. Princeton: Princeton University Press.
Compétences requises
– Compétences en analyses statistiques (GLMM) et SIG, maîtrise du logiciel R (www.r-project.org)
– Connaissances en écologie spatiale
– Goût pour la modélisation
– Rigueur, autonomie, sens relationnel
– Maitrise de l’anglais
– Capacités rédactionnelles
– Conditions physiques (mission de terrain)
– Permis B
Gratification et conditions d’accueil
La gratification sera d’environ 580 euros/mois. Le ou la stagiaire sera basé(e) à l’UMR EGCE, campus CNRS de Gif-sur-Yvette. Des missions de terrain seront organisées vers les diverses sites d’étude.
