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Etude des transferts horizontaux de gènes de guêpes parasitoïdes à leurs lépidoptères hôtes.

Stage co-dirigé par Clément Gilbert (EGCE) et Elisabeth Huguet (IRBI, Tours)

Email : clement.gilbert@etce.cnrs-gif.fr

La plupart des guêpes parasitoïdes (Hymenoptera, Ichneumonoidea) sont koïnobiontes, c’est-à-dire qu’elles effectuent leur développement larvaire à l’intérieur des arthropodes qu’elles parasitent en maintenant ceux-ci en vie jusqu’à leur propre nymphose (Beckage and Drezen 2012). Ce type d’association intime et durable implique des interactions physiologiques et immunitaires relativement complexes entre les guêpes et leurs hôtes. Plusieurs familles de guêpes ont même domestiqué des gènes viraux intégrés dans leur génome, leur permettant de synthétiser des particules virales non réplicatives qu’elles injectent en même temps que leurs œufs dans les larves de leurs hôtes (Herniou et al. 2013 ; Drezen et al. 2017). Ces particules contiennent des facteurs de virulence (ADNs circulaires, protéines) qui atténuent la réponse immunitaire de l’hôte et facilitent ainsi le développement des larves de guêpes. Une étude récente réalisée en laboratoire à l’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI ; université de Tours) montre que de nombreuses copies des cercles d’ADN encapsidés dans les particules virales de la guêpe Cotesia congregata (Braconidae) sont intégrées de manière systématique, à chaque infection, dans le génome des cellules immunitaires de son hôte (le sphinx du tabac, Manduca sexta) (Chevignon et al. 2018). Ce phénomène de transformation génomique d’un hôte par son parasite eucaryote est unique. Il pourrait permettre, en absence de réplication virale, aux gènes viraux d’être maintenus et exprimés dans les cellules hôtes pendant tout le temps nécessaire au développement des embryons de guêpes. Cependant, le rôle joué par ces intégrations et leur importance dans les interactions guêpes/hôtes restent encore à éclaircir. Par ailleurs, on sait que certaines populations d’hôtes peuvent devenir résistantes au parasitisme, et donc survivre aux infections. Si des intégrations de cercles d’ADN de virus se produisaient dans la lignée germinale de ces populations résistantes, elles pourraient être transmises verticalement. Les interactions entre guêpes parasitoïdes et leurs hôtes offrent donc un contexte propice aux transferts horizontaux de matériel génétique (TH) entre espèces.

De manière générale, les TH semblent avoir joué un rôle plus important qu’on ne le pensait auparavant dans l’évolution des eucaryotes (Loreto et al. 2008; Schaack et al. 2010; Syvanen 2012; Boto 2014). Cependant les mécanismes expliquant ces transferts restent inconnus (Gilbert & Cordaux 2017). Plusieurs travaux montrent que des TH de gènes de guêpes parasitoïdes à des lépidoptères ont bien eu lieu dans le passé (Schneider and Thomas 2014; Gasmi et al. 2015). Mais ceux-ci sont trop anciens pour espérer comprendre comment ils se sont produits. La découverte des intégrations systématiques d’ADN viraux associés aux guêpes dans les génomes de lépidoptères parasités offre une opportunité unique de faire la lumière sur un des mécanismes possibles de TH entre animaux.

Le projet aura pour objectif de caractériser la fréquence des intégrations de cercles d’ADN d’un virus d’une guêpe proche de C. congregata (Cotesia typhae, (Kaiser et al. 2017)) chez différentes populations et espèces de lépidoptères. Il vise également à évaluer la possibilité que ces intégrations se produisent dans la lignée germinale et soient transmises verticalement chez des hôtes résistants. Les patrons d’intégration dans les cellules somatiques (hémocytes, corps gras) et germinales seront comparés entre populations sensibles et résistantes d’une espèce de lépidoptère cible, la sésamie du maïs, Sesamia nonagrioides (Benoist et al. 2017) et entre S. nonagrioides et une espèce qui n’est pas un hôte naturel (la pyrale du maïs, Ostrinia nubilalis). Les intégrations seront recherchées non seulement chez des individus parasités au laboratoire mais également dans des populations naturelles.

 

Références

Beckage, N. E., and J.-M. Drezen (Eds.), 2012 Parasitoid viruses: symbionts and pathogens. Elsevier/Academic Press, London ; New York.

Benoist, R., C. Chantre, C. Capdevielle-Dulac, M. Bodet, F. Mougel et al., 2017 Relationship between oviposition, virulence gene expression and parasitism success in Cotesia typhae nov. sp. parasitoid strains. Genetica 145: 469–479.

Boto, L., 2014 Horizontal gene transfer in the acquisition of novel traits by metazoans. Proc Biol Sci 281: 20132450.

Burke, G. R., S. A. Thomas, J. H. Eum, and M. R. Strand, 2013 Mutualistic Polydnaviruses Share Essential Replication Gene Functions with Pathogenic Ancestors (D. S. Schneider, Ed.). PLoS Pathog. 9: e1003348.

Chevignon G, Periquet G, Gyapay G, Vega-Czarny N, Musset K, Drezen JM, Huguet E. Cotesia congregata Bracovirus Circles Encoding PTP and Ankyrin Genes Integrate into the DNA of Parasitized Manduca sexta Hemocytes. J Virol. 2018 92(15).

Drezen, J.-M., M. Leobold, A. Bézier, E. Huguet, A.-N. Volkoff et al., 2017 Endogenous viruses of parasitic wasps: variations on a common theme. Curr. Opin. Virol. 25: 41–48.

Gasmi, L., H. Boulain, J. Gauthier, A. Hua-Van, K. Musset et al., 2015 Recurrent Domestication by Lepidoptera of Genes from Their Parasites Mediated by Bracoviruses. PLoS Genet. 11: e1005470.

Gilbert, C., and R. Cordaux, 2017 Viruses as vectors of horizontal transfer of genetic material in eukaryotes. Curr. Opin. Virol. 25: 16–22.

Herniou, E. A., E. Huguet, J. Theze, A. Bezier, G. Periquet et al., 2013 When parasitic wasps hijacked viruses: genomic and functional evolution of polydnaviruses. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 368: 20130051.

Kaiser, L., J. Fernandez-Triana, C. Capdevielle-Dulac, C. Chantre, M. Bodet et al., 2017 Systematics and biology of Cotesia typhae sp. n. (Hymenoptera, Braconidae, Microgastrinae), a potential biological control agent against the noctuid Mediterranean corn borer, Sesamia nonagrioides. ZooKeys 682: 105–136.

Loreto, E. L., C. M. Carareto, and P. Capy, 2008 Revisiting horizontal transfer of transposable elements in Drosophila. Hered. Edinb 100: 545–54.

Schaack, S., C. Gilbert, and C. Feschotte, 2010 Promiscuous DNA: horizontal transfer of transposable elements and why it matters for eukaryotic evolution. Trends Ecol Evol 25: 537–46.

Schneider, S. E., and J. H. Thomas, 2014 Accidental genetic engineers: horizontal sequence transfer from parasitoid wasps to their Lepidopteran hosts. PloS One 9: e109446.

Syvanen, M., 2012 Evolutionary implications of horizontal gene transfer. Annu. Rev. Genet. 46: 341–58.

 

Contexte, compétences recherchées, et encadrement

Nous recherchons un/e étudiant/e enthousiaste et motivé/e et ayant de bonnes connaissances en évolution génomique. Une des tâches principales du stage de M2 consistera à assembler et annoter le génome de Sesamia nonagrioides (en combinant des données illumina et PacBio). L’étudiant/e devra donc être à l’aise sur un terminal Unix et de préférence maitriser au moins un langage de programmation. Idéalement, l’étudiant/e réaliserait aussi quelques manips pilotes de biologie moléculaire de paillasse consistant à rechercher par PCR des inserts de Cotesia typhae dans des populations de lépidoptères. Nous prévoyons de continuer ce projet sur la durée d’une thèse, dont le financement devra être acquis par l’étudiant/e qui pourra postuler à l’école doctorale SDSV de l’université Paris-Saclay. Le stage se déroulera entièrement au laboratoire EGCE à Gif sur Yvette et sera encadré par Clément Gilbert (EGCE) et Elisabeth Huguet (IRBI, Tours).

Etude des transferts horizontaux de gènes de guêpes parasitoïdes à leurs lépidoptères hôtes.

La plupart des guêpes parasitoïdes (Hymenoptera, Ichneumonoidea) sont koïnobiontes, c’est-à-dire qu’elles effectuent leur développement larvaire à l’intérieur des arthropodes qu’elles parasitent en maintenant ceux-ci en vie jusqu’à leur propre nymphose (Beckage and Drezen 2012). Ce type d’association intime et durable implique des interactions physiologiques et immunitaires relativement complexes entre les guêpes et leurs hôtes. Plusieurs familles de guêpes ont même domestiqué des gènes viraux intégrés dans leur génome, leur permettant de synthétiser des particules virales non réplicatives qu’elles injectent en même temps que leurs œufs dans les larves de leurs hôtes (Herniou et al. 2013 ; Drezen et al. 2017). Ces particules contiennent des facteurs de virulence (ADNs circulaires, protéines) qui atténuent la réponse immunitaire de l’hôte et facilitent ainsi le développement des larves de guêpes. Une étude récente réalisée en laboratoire à l’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI ; université de Tours) montre que de nombreuses copies des cercles d’ADN encapsidés dans les particules virales de la guêpe Cotesia congregata (Braconidae) sont intégrées de manière systématique, à chaque infection, dans le génome des cellules immunitaires de son hôte (le sphinx du tabac, Manduca sexta) (Chevignon et al. 2018). Ce phénomène de transformation génomique d’un hôte par son parasite eucaryote est unique. Il pourrait permettre, en absence de réplication virale, aux gènes viraux d’être maintenus et exprimés dans les cellules hôtes pendant tout le temps nécessaire au développement des embryons de guêpes. Cependant, le rôle joué par ces intégrations et leur importance dans les interactions guêpes/hôtes restent encore à éclaircir. Par ailleurs, on sait que certaines populations d’hôtes peuvent devenir résistantes au parasitisme, et donc survivre aux infections. Si des intégrations de cercles d’ADN de virus se produisaient dans la lignée germinale de ces populations résistantes, elles pourraient être transmises verticalement. Les interactions entre guêpes parasitoïdes et leurs hôtes offrent donc un contexte propice aux transferts horizontaux de matériel génétique (TH) entre espèces.

De manière générale, les TH semblent avoir joué un rôle plus important qu’on ne le pensait auparavant dans l’évolution des eucaryotes (Loreto et al. 2008; Schaack et al. 2010; Syvanen 2012; Boto 2014). Cependant les mécanismes expliquant ces transferts restent inconnus (Gilbert & Cordaux 2017). Plusieurs travaux montrent que des TH de gènes de guêpes parasitoïdes à des lépidoptères ont bien eu lieu dans le passé (Schneider and Thomas 2014; Gasmi et al. 2015). Mais ceux-ci sont trop anciens pour espérer comprendre comment ils se sont produits. La découverte des intégrations systématiques d’ADN viraux associés aux guêpes dans les génomes de lépidoptères parasités offre une opportunité unique de faire la lumière sur un des mécanismes possibles de TH entre animaux.

Le projet aura pour objectif de caractériser la fréquence des intégrations de cercles d’ADN d’un virus d’une guêpe proche de C. congregata (Cotesia typhae, (Kaiser et al. 2017)) chez différentes populations et espèces de lépidoptères. Il vise également à évaluer la possibilité que ces intégrations se produisent dans la lignée germinale et soient transmises verticalement chez des hôtes résistants. Les patrons d’intégration dans les cellules somatiques (hémocytes, corps gras) et germinales seront comparés entre populations sensibles et résistantes d’une espèce de lépidoptère cible, la sésamie du maïs, Sesamia nonagrioides (Benoist et al. 2017) et entre S. nonagrioides et une espèce qui n’est pas un hôte naturel (la pyrale du maïs, Ostrinia nubilalis). Les intégrations seront recherchées non seulement chez des individus parasités au laboratoire mais également dans des populations naturelles.

 

Références

Beckage, N. E., and J.-M. Drezen (Eds.), 2012 Parasitoid viruses: symbionts and pathogens. Elsevier/Academic Press, London ; New York.

Benoist, R., C. Chantre, C. Capdevielle-Dulac, M. Bodet, F. Mougel et al., 2017 Relationship between oviposition, virulence gene expression and parasitism success in Cotesia typhae nov. sp. parasitoid strains. Genetica 145: 469–479.

Boto, L., 2014 Horizontal gene transfer in the acquisition of novel traits by metazoans. Proc Biol Sci 281: 20132450.

Burke, G. R., S. A. Thomas, J. H. Eum, and M. R. Strand, 2013 Mutualistic Polydnaviruses Share Essential Replication Gene Functions with Pathogenic Ancestors (D. S. Schneider, Ed.). PLoS Pathog. 9: e1003348.

Chevignon G, Periquet G, Gyapay G, Vega-Czarny N, Musset K, Drezen JM, Huguet E. Cotesia congregata Bracovirus Circles Encoding PTP and Ankyrin Genes Integrate into the DNA of Parasitized Manduca sexta Hemocytes. J Virol. 2018 92(15).

Drezen, J.-M., M. Leobold, A. Bézier, E. Huguet, A.-N. Volkoff et al., 2017 Endogenous viruses of parasitic wasps: variations on a common theme. Curr. Opin. Virol. 25: 41–48.

Gasmi, L., H. Boulain, J. Gauthier, A. Hua-Van, K. Musset et al., 2015 Recurrent Domestication by Lepidoptera of Genes from Their Parasites Mediated by Bracoviruses. PLoS Genet. 11: e1005470.

Gilbert, C., and R. Cordaux, 2017 Viruses as vectors of horizontal transfer of genetic material in eukaryotes. Curr. Opin. Virol. 25: 16–22.

Herniou, E. A., E. Huguet, J. Theze, A. Bezier, G. Periquet et al., 2013 When parasitic wasps hijacked viruses: genomic and functional evolution of polydnaviruses. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 368: 20130051.

Kaiser, L., J. Fernandez-Triana, C. Capdevielle-Dulac, C. Chantre, M. Bodet et al., 2017 Systematics and biology of Cotesia typhae sp. n. (Hymenoptera, Braconidae, Microgastrinae), a potential biological control agent against the noctuid Mediterranean corn borer, Sesamia nonagrioides. ZooKeys 682: 105–136.

Loreto, E. L., C. M. Carareto, and P. Capy, 2008 Revisiting horizontal transfer of transposable elements in Drosophila. Hered. Edinb 100: 545–54.

Schaack, S., C. Gilbert, and C. Feschotte, 2010 Promiscuous DNA: horizontal transfer of transposable elements and why it matters for eukaryotic evolution. Trends Ecol Evol 25: 537–46.

Schneider, S. E., and J. H. Thomas, 2014 Accidental genetic engineers: horizontal sequence transfer from parasitoid wasps to their Lepidopteran hosts. PloS One 9: e109446.

Syvanen, M., 2012 Evolutionary implications of horizontal gene transfer. Annu. Rev. Genet. 46: 341–58.

 

Contexte, compétences recherchées, et encadrement

Nous recherchons un/e étudiant/e enthousiaste et motivé/e et ayant de bonnes connaissances en évolution génomique. Une des tâches principales du stage de M2 consistera à assembler et annoter le génome de Sesamia nonagrioides. L’étudiant/e devra donc être à l’aise sur un terminal Unix et de préférence maitriser au moins un langage de programmation. Idéalement, l’étudiant/e réaliserait aussi quelques manips pilotes de biologie moléculaire de paillasse consistant à rechercher par PCR des inserts de Cotesia typhae dans des populations de lépidoptères. Nous prévoyons de continuer ce projet sur la durée d’une thèse, dont le financement devra être acquis par l’étudiant/e qui pourra postuler à l’école doctorale SDSV de l’université Paris-Saclay. Le stage se déroulera entièrement au laboratoire EGCE à Gif sur Yvette et sera encadré par Clément Gilbert (EGCE) et Elisabeth Huguet (IRBI, Tours).

 

Contact : clement.gilbert@egce.cnrs-gif.fr

Clément, Gilbert

PROPOSITION DE STAGES DE MASTER 2

ENGLISH WEBPAGE

Chargé de recherche CNRS (CR1, HDR)

Laboratoire Evolution, Génomes, Comportement, Ecologie
CNRS Université Paris-Sud UMR 9191 IRD UMR 247
Avenue de la Terrasse, Bâtiment 13, Boite Postale 1
91198 Gif sur Yvette
France
email: clement.gilbert@egce.cnrs-gif.fr
Tel: +33 1 69 82 37 37

Membre de IGGIPOP

RECHERCHE

  • Rôle des virus dans les transferts horizontaux de matériel génétique entre animaux

Financement: ANR JCJC (15-CE32-0011-01 TransVir), Nov. 2015 – Nov. 2020. Rôle: Porteur

  • Impact des symbiotes féminisants sur l’évolution des systèmes de détermination du sexe

Financement: ANR PRC (15-CE32-0006-01), Jan. 2016 – Jan. 2021. Porteur: R. Cordaux (UMR CNRS EBI 7267, Université de Poitiers)

PUBLICATIONS

#contribution égale ; *étudiant(e)/postdoc encadré(e)

Lien Google Scholar: http://scholar.google.fr/citations?hl=fr&user=U5WMppQAAAAJ&view_op=list_works&pagesize=100

2018

  • Gaulin, E., M. J. C. Pel, L. Camborde, H. San-Clemente, S. Courbier, M.-A. Dupouy, J. Lengelle, M. Veyssiere, A. Le Ru, F. Grandjean, R. Cordaux, B. Moumen, C. Gilbert, L. M. Cano, J.-M. Aury, J. Guy, P. Wincker, O. Bouchez, C. Klopp & B. Dumas (2018) Genomics analysis of Aphanomyces spp. identifies a new class of oomycete effector associated with host adaptation. Bmc Biology, 16. 10.1186/s12915-018-0508-5.
  • Gilbert, C. & C. Feschotte (2018) Horizontal acquisition of transposable elements and viral sequences: patterns and consequences. Current opinion in genetics & development, 49, 15-24. 10.1016/j.gde.2018.02.007.
  • Lewis, S., K. Quarles, Y. Yang, M. Tanguy, L. Frezal, S. Smith, P. Sharma, R. Cordaux, C. Gilbert, I. Giraud, D. Collins, P. Zamore, E. Miska, P. Sarkies & F. Jiggins (2018) Pan-arthropod analysis reveals somatic piRNAs as an ancestral defence against transposable elements. Nature Ecology & Evolution, In press. 10.1038/s41559-017-0403-4.
  • Peccoud, J., R. Cordaux & C. Gilbert (2018a) Analyzing Horizontal Transfer of Transposable Elements on a Large Scale: Challenges and Prospects. BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology, 40(2). 10.1002/bies.201700177.
  • Peccoud, J., S. Lequime, I. Moltini-Conclois, I. Giraud, L. Lambrechts & C. Gilbert (2018b) A Survey of Virus Recombination Uncovers Canonical Features of Artificial Chimeras Generated During Deep Sequencing Library Preparation. G3-Genes Genomes Genetics, 8, 1129-1138. 10.1534/g3.117.300468.

2017

  • Cordaux R., Gilbert C. Evolutionary significance of Wolbachia-to-animal horizontal gene transfer: female sex determination and the f element in the isopod Armadillidium vulgare. Genes (In press)
  • Peccoud J., Chebbi M.A., Cormier A., Moumen B., Gilbert C., Marcadé I., Chandler C., Cordaux R. Untangling heteroplasmy, structure, and evolution of an atypical mitochondrial genome by PacBio sequencing. Genetics (In press)
  • Gilbert C., Cordaux R. Viruses as vectors of horizontal transfer of transposable elements. Curr. Opin. Virol. 25: 16-22. (2017)
  • Loiseau V.*, Giraud I., Federici B., Bigot Y., Cordaux R., Gilbert C. Iridovirus IIV31: a remarkable virus infecting terrestrial isopods. Virologie 21 : 147-149. (2017)
  • Peccoud J., Loiseau V.*, Cordaux R., Gilbert C. Massive horizontal transfer of transposable elements in insects. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 114(18): 4721-4726. (2017)
  • Becking T.*, Giraud I., Raimond M., Moumen B., Chandler C., Cordaux R.#, Gilbert C.# Diversity and evolution of sex determination systems in terrestrials isopods. Sci. Rep. 7: 1084. (2017)

2016

  • Leclercq S., Thézé J., Chebbi MA, Giraud I, Moumen B, Ernenwein L., Grève P., Gilbert C., Cordaux R. Birth of a W sex chromosome by horizontal transfer of Wolbachia bacterial symbiont genome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 113(52): 15036–15041. (2016)
  • Gilbert C., Feschotte C. Virus et gènes viraux endogènes : évolution et impact. Virologie 20(3) : 158 – 173. (2016)
  • Gilbert C., Peccoud J., Chateigner A., Moumen B., Cordaux R#., Herniou E#. Continuous influx of genetic material from host to virus populations. PLOS Genet. 12 (2), e1005838 (2016)

2015

  • Metegnier G.*, Becking T., Chebbi M.A., Giraud I., Moumen B., Schaack S., Cordaux R., Gilbert C. Comparative paleovirological analysis of crustaceans identifies multiple widespread viral groups. Mob. DNA 6: 16. (2015)
  • Cerveau N., Gilbert C., Liu C., Garrett R.A., Grève P., Bouchon D., Cordaux R. Genomic context drives transcription of insertion sequences in the bacterial endosymbiont Wolbachia wVulC. Gene 564: 81-86 (2015)

2014

  • Thézé J.*, Leclercq S., Moumen B., Cordaux R., Gilbert C. Remarkable diversity of endogenous viruses in a crustacean isopod. Genome Biol. Evol. 6(8): 2129–2140 (2014)
  • Gilbert C., Meik J.M., Card D.C., Castoe T.A., Schaack S. Endogenous hepadnaviruses, bornaviruses and circoviruses in snakes. Proc. Biol. Soc. B 281: 1791. (2014)
  • Dupeyron M.*, Leclercq S., Cerveau N., Bouchon D., Gilbert C. Horizontal transfer of transposons within and between insects and crustaceans. Mob. DNA 5:4. (2014)
  • Gilbert C., Chateigner A., Ernenwein L., Bézier A., Barbe V., Herniou E.#, Cordaux R.# Population genomics supports baculoviruses as vectors of horizontal transfer of insect transposons. Nature Commun. 5: 3348. (2014)

2013

  • Gilbert C., Cordaux R. Horizontal transfer and evolution of prokaryote transposable elements in eukaryotes. Genome Biol Evol. 5: 822 – 832. (2013)
  • Gilbert C., Waters P.D., Feschotte C., Schaack S. Horizontal transfer of OC1 transposons in the Tasmanian devil. BMC Genomics 14: 134. (2013)

2012

  • Leclercq S., Gilbert C., Cordaux R. Cargo capacity of phages and plasmids and other factors influencing horizontal transfers of prokaryote transposable elements. Mobile Genetic Elements 2: 115-118. (2012)
  • Feschotte C., Gilbert C. Endogenous viruses: insights into viral evolution and impact on host biology. Nature Rev. Genetics 13: 283-296. (2012)
  • Al Nadaf S., Deakin J.E., Gilbert C., Robinson T.J., Graves J.A., Waters P.D. A cross-species comparison of escape from X inactivation in Eutheria: implications for evolution of X chromosome inactivation. Chromosoma 121: 71-78. (2012)
  • Gilbert C., Hernandez S.*, Flores-Benabib J.*, Smith E., Feschotte C. Rampant horizontal transfer of SPIN transposons in squamate reptiles. Mol. Biol. Evol. 29: 503-515. (2012)

2011

  • Solano E., Gilbert C., Richards L., Taylor P. J., Soarimalala V., Engelbrecht A., Goodman S.M., Robinson T. J. First karyotypic descriptions of Malagasy rodents (Nesomyinae, Muridae) reveal variation at multiple taxonomic levels. J. Zool. 285: 110-118. (2011)
  • Chaumeil J., Waters P. D., Koina E., Gilbert C., Robinson T. J., Marshall Graves J. A. Evolution of XIST-controlled X chromosome inactivation: Epigenetic modifications in distantly related mammals. PLoS ONE 6: e19040. (2011)

2010

  • Gilbert C., Feschotte C. Genomic fossils calibrate the long-term evolution of hepatitis B viruses. PLoS Biol. 8: 9: e1000495. (2010)
  • Schaack S. R.#, Gilbert C.#, Feschotte C. Promiscous DNA: horizontal transfer of transposable elements and why it matters for eukaryotic evolution. Trends Ecol. Evol. 25: 537-546. (2010)
  • Gilbert C.#, Schaack S. R.#, Pace II J. K., Brindley P. J., Feschotte C. A role for host-parasite interactions in the horizontal transfer of transposons across phyla. Nature 464: 1347 – 1350. (2010)

2009

  • Rodríguez Delgado C.L., Waters P.D., Gilbert C., Robinson T.J., Marshall Graves J.A. Physical mapping of the elephant X chromosome: conservation of gene order over 105 million years. Chromosome Res. 17: 833 – 945. (2009)
  • Gilbert C., Maxfield D. G.*, Goodman S. M., Feschotte C. Parallel germline infiltration of a lentivirus in two Malagasy lemurs. PLOS Genet. 5: 3: e1000425. (2009)
  • Gilbert C., Pace II J. K., Feschotte C. Horizontal SPINning of transposons. Commun. Integr. Biol. 2: 117 – 119. (2009)

2008

  • Ropiquet A., Gerbault-Seureau M., Deuve J. L., Gilbert C., Pagacova E., Chai N., Rubes J., Hassanin A., Chromosome evolution in the subtribe Bovina (Mammalia, Bovidae): The karyotype of the Cambodian banteng (Bos javanicus birmanicus) suggests that Robertsonian translocations are related to interspecific hybridization. Chromosome Res. 16: 1107 – 1118. (2008)
  • Pace II J. K., Gilbert C., Clark M.*, Feschotte C. Repeated horizontal transfer of a DNA transposon in mammals and other tetrapods. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105: 17023 – 17028. (2008)
  • Gilbert C., Pace II J. K., Waters P. D. Target site analysis of RTE1_LA and its AfroSINE partner in the elephant genome. Gene 425: 1 – 8. (2008)
  • Gilbert C., Maree S., Robinson T. J. Chromosomal evolution and distribution of telomeric repeats in golden moles. Cytogenet. Genome Res. 121: 110 – 119. (2008)

2007

  • Gilbert C., Goodman S.M., Soarimalala V., Olson L.E., O’Brien P.C.M., Elder F.F.B., Yang F., Ferguson-Smith M.A., and Robinson T.J. Chromosomal evolution in tenrecs (Microgale and Oryzorictes, Tenrecidae) from the Central Highlands of Madagascar. Chromosome Res. 15: 1075 – 1091. (2007)

2006

  • Gilbert C., O’Brien P.C., Bronner G., Yang F., Hassanin A., Ferguson-Smith M.A., Robinson T. J. Chromosome painting and molecular dating indicate a low rate of chromosomal evolution in golden moles (Mammalia, Chrysochloridae). Chromosome Res. 14: 793-803. (2006)
  • Gilbert C., Ropiquet A., Hassanin A. Mitochondrial and nuclear phylogenies of Cervidae (Mammalia, Ruminantia): systematics, morphology and biogeography. Mol. Phylogenet. Evol. 40: 101-118. (2006)

ARTICLES DE VULGARISATION

  • Gilbert C., Peccoud J. Les éléments génétiques mobiles d’insectes sautent fréquemment dans les génomes de virus. Med Sci. (Paris) 32: 1017-1019. (2016)
  • Gilbert C., Schaack S., Feschotte C. Quand les éléments génétiques mobiles bondissent entre espèces animales. Med. Sci. (Paris) 26: 1025 – 1027. (2010)

Cécile Courret

Téléphone: 01 69 82 37 07

Doctorante de l’École Doctorale « Structure et Dynamique des Systèmes Vivants », Université Paris-Saclay.

Bases moléculaires du conflit génétique induit par la distorsion de ségrégation des chromosomes sexuels chez Drosophila simulans.

Encadrement : Catherine Montchamp-Moreau.